大学病院や教育機関の場合、ある程度は仕方ないですが、どうしても嫌なら申し出ていいと思います。
何も質問しないと、理解していると思われている可能性があります。
急変の場合は予約など気にせず、病院に連絡してよいと思います。
直接言いにくい場合は、お手紙を出してみてはいかがですか。
乳児のうち、落ち着かないうちは主治医を訪ねるのが安心です。でも症状や親の対応が慣れてくると、先生の判断により症状によっては近くの小児科で対応をお願いできることもあるようなので、折を見て相談してもいいと思います。